產(chǎn)品及特點(diǎn):
克羅諾桿菌(Cronobacter spp.)是一種重要的新型食源性致病菌,是囊括了原來所有阪崎腸桿菌(Enterobacter sakazakii)的新屬,該屬的細(xì)菌是人和動(dòng)物腸道內(nèi)寄生的一種有周生鞭毛,能運(yùn)動(dòng),兼性厭氧的革蘭陰性無芽孢桿菌。該菌呈世界性分布,主要通過嬰幼兒配方奶粉經(jīng)消化道感染兒童,引起新生兒腦膜炎、敗血癥和壞死性結(jié)腸炎,甚或遺留神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥或?qū)е滤劳觥W?1961年首次報(bào)道由克羅諾桿菌引起的兩例腦膜炎病例,隨后在全球范圍內(nèi)相繼出現(xiàn)了由該菌引起的疾病報(bào)道。本公司開發(fā)了簡(jiǎn)單快捷的克羅諾桿菌通用探針法熒光定量 PCR 檢測(cè)試劑盒。
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品 DNA 模板。
2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高。
3. 提供陽性對(duì)照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據(jù)克羅諾桿菌通用高度保守區(qū)設(shè)計(jì),不會(huì)跟其他病毒 DNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 PCR 反應(yīng)。
規(guī)格及成分:
編號(hào)
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成分
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規(guī)格
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試劑一
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2×Probe qPCR MagicMix
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500μL(本色蓋)
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試劑三
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熒光PCR專用模板稀釋液
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1mL(黃蓋)
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試劑二
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克羅諾桿菌通用探針法qPCR引物混合液
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100μL(白蓋)
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試劑四
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克羅諾桿菌通用探針法qPCR探針
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50μL(棕色管)
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試劑五
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克羅諾桿菌通用探針法qPCR陽性對(duì)照(1×10E8/μL)
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50μL(紅蓋)
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使用手冊(cè)
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1份
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運(yùn)輸及保存:
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為 12 個(gè)月。
自備試劑:
樣品DNA。
使用方法:
一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個(gè) 10 倍稀釋度為例):
由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對(duì)照,只提供無傳染性的 DNA 片段作為陽性對(duì)照。
1. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
3. 在 7 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對(duì)照(試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號(hào)管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對(duì)照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。
6. 放冰上待用。重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備:
7. 如果有 N 個(gè)樣品,最好設(shè)置 N+2 個(gè)提取,多出的一個(gè)是 PC(樣品制備陽性對(duì)照),一個(gè)是 NC(樣品制備陰性對(duì)照)。可以用 10μL 陽性對(duì)照的 10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為 NC。
8. 用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場(chǎng)上大多數(shù) DNA 提取試劑盒兼容。
三、Probe qPCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進(jìn)行):
9. 如果做定量分析并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+9 個(gè) PCR 管,其中 N+2 個(gè)用于上步得到的 N+2 個(gè)樣品,1 個(gè)用于 PCR 陰性對(duì)照(用水做模板),6個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析,并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+4 個(gè) PCR管,其中 N+2 個(gè)用于上步得到的 N+2 個(gè)樣品,1 個(gè)用于 PCR 陰性對(duì)照(用水做模板),1 個(gè)用于 PCR 陽性對(duì)照(用第 4 號(hào)管的陽性對(duì)照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
10. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對(duì)照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對(duì)照,并且陽性對(duì)照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲(chǔ)存好后最后加):
成份
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N+2個(gè)樣品管
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PCR陰性對(duì)照管
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標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品管2-7管
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2×Probe qPCR MagicMix
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10μL
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10μL
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各10μL
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克羅諾桿菌通用探針法qPCR探針
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1μL
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1μL
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各1μL
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克羅諾桿菌通用探針法qPCR引物混合液
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2μL
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2μL
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各2μL
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N+2個(gè)待測(cè)DNA模板
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7μL
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超純水
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7μL
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第7步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液2-7號(hào)
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各7μL2號(hào)樣到2號(hào)管,3號(hào)樣到3號(hào)管
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11. 蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行PCR:
過程
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溫度
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時(shí)間
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預(yù)變性
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95℃
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3 min
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PCR反應(yīng)40個(gè)循環(huán)
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95℃
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15 sec
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60℃
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1 min(采集FAM通道的熒光信號(hào))
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四、數(shù)據(jù)處理:
12. 如果把本試劑盒用于定量檢測(cè),則以陽性對(duì)照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測(cè)樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 RNA濃度的 log 值,再推算出其濃度。
13. 如果把本試劑盒用于定性檢測(cè),只判斷陽性或陰性,則陰性對(duì)照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對(duì)照必須有熒光對(duì)數(shù)增長(zhǎng),有典型擴(kuò)增曲線,Ct 值應(yīng)該小于或等于 30。對(duì)待測(cè)樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復(fù)一次。若重復(fù)結(jié)果 Ct值小于 40,擴(kuò)增曲線有明顯起峰,該樣本判斷為陽性,否則為陰性。
五、特別提示:
本公司的所有產(chǎn)品,僅可用于科研實(shí)驗(yàn),嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!