產品及特點:
JC 病毒( John Cunningham Virus , JCV )屬于乳多空病毒科(Papovaviridae)多瘤病毒屬(Orthopolyomavirus),1971 年從進行性多灶性白質腦病( progressive multifocal leukoencephalopathy,PML)患者的腦中分離并以該患者名字命名,普通人群血清陽性檢測率為 40%~60%,因AIDS 并發 PML 的患者致死率約為 50%,對于免疫力缺陷和免疫力低下的既往感染者,還會引起多瘤病毒相關性腎 病 ( polyomavirus-associatednephropathy,PVAN)、病毒血癥等相關疾病,并與胃癌、肺癌、食管癌等癌癥的發生密切相關,但其致病機理尚未闡明。
由于目前無特異的預防和治療方法,因此在病毒感染早期的準確檢測對疾病的診斷和治療十分關鍵,尤其在免疫低下的人群中實現高效、精準、及時的檢測至關重要。本產品就是以探針法熒光定量PCR 技術為基礎開發的專門檢測 JC 病毒的試劑盒。
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品 DNA 模板。
2. 引物和探針經過優化,靈敏性高。
3. 提供陽性對照,便于區分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據JC病毒高度保守區設計,不會跟其他病毒 DNA發生交叉反應。
5. 本產品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 PCR 反應。
規格及成分:
編號
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成分
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規格
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試劑一
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2×Probe qPCR MagicMix
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500μL(本色蓋)
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試劑二
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熒光PCR專用模板稀釋液
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1mL(黃蓋)
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試劑三
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JC病毒qPCR引物混合液
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100μL(白蓋)
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試劑四
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JC病毒qPCR探針
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50μL(棕色管)
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試劑五
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JC病毒探針法qPCR陽性對照(1×10E8/μL)
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50μL(紅蓋)
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使用手冊
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1 份
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運輸及保存:
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為 12 個月。
自備試劑:
樣品DNA。
使用方法:
一、稀釋標準曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例):
由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 片段作為陽性對照。
1. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
3. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標準曲線樣品。
6. 放冰上待用。重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備:
7. 如果有 N 個樣品,最好設置 N+2 個提取,多出的一個是 PC(樣品制備陽性對照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)。可以用 10μL 陽性對照的 10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為 NC。
8. 用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數 DNA 提取試劑盒兼容。
三、Probe qPCR反應(20μL體系,在樣品制備室進行):
9. 如果做定量分析并且只做 1 次重復,則標記 N+9 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),6個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做 1 次重復,則標記 N+4 個 PCR管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),1 個用于 PCR 陽性對照(用第 4 號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
10. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最后加):
成份
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N+2 個樣品管
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PCR 陰性對照管
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標準曲線樣品管2-7管
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2×Probe qPCR MagicMix
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10μL
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10μL
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各10μL
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JC病毒qPCR探針
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1μL
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1μL
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各1μL
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JC病毒探針法qPCR引物混合液
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2μL
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2μL
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各2μL
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N+2個待測DNA模板
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7μL
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超純水
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7μL
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第7步所得標準曲線樣品稀釋液(2-7號)
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各7μL2號樣到2號管,3號樣到3號管
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11. 蓋上蓋子后上機,按下面參數進行PCR:
過程
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溫度
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時間
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預變性
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95℃
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3 min
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PCR反應40個循環
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95℃
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15 sec
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60℃
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1 min(采集FAM通道的熒光信號)
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四、數據處理:
12. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品 RNA濃度的 log 值,再推算出其濃度。
13. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數增長,有典型擴增曲線,Ct 值應該小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復一次。若重復結果 Ct值小于 40,擴增曲線有明顯起峰,該樣本判斷為陽性,否則為陰性。
五、特別提示:
本公司的所有產品,僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途!